Modul složek

FreeDocs implementuje systém složek podobný, jako je tomu ve standardním souborovém systému.
Oproti standardnímu souborovému systému může být jeden dokument/složka umístěn ve více složkách současně přičemž se neustále jedná o jednu a tutéž kopii dokumentu. Smazáním složky tak systém nepřichází o její obsah, ale pouze o informaci, že daný dokument je také zařazen v dané složce. Dokument je tak stále dohledatelný s použitím jeho profilu.